MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB8 plasmid pTT27

Total Repeats: 6037

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006462	GGC	2	6	18	23	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978184
2	NC_006462	CAC	2	6	62	67	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978184
3	NC_006462	CCCT	2	8	96	103	0 %	25 %	0 %	75 %	55978184
4	NC_006462	CTCC	2	8	117	124	0 %	25 %	0 %	75 %	55978184
5	NC_006462	GCC	2	6	146	151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978184
6	NC_006462	CGC	2	6	193	198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978184
7	NC_006462	CAC	2	6	204	209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978184
8	NC_006462	ACC	2	6	534	539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978185
9	NC_006462	AGG	2	6	540	545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978185
10	NC_006462	CCT	2	6	595	600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978185
11	NC_006462	TGCTG	2	10	682	691	0 %	40 %	40 %	20 %	55978185
12	NC_006462	AAC	2	6	726	731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55978185
13	NC_006462	G	6	6	757	762	0 %	0 %	100 %	0 %	55978185
14	NC_006462	AAGG	2	8	1040	1047	50 %	0 %	50 %	0 %	55978186
15	NC_006462	GTT	2	6	1087	1092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55978186
16	NC_006462	TCCA	2	8	1120	1127	25 %	25 %	0 %	50 %	55978186
17	NC_006462	GCC	4	12	1219	1230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978186
18	NC_006462	C	6	6	1339	1344	0 %	0 %	0 %	100 %	55978187
19	NC_006462	CCT	2	6	1370	1375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978187
20	NC_006462	CTC	2	6	1380	1385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978187
21	NC_006462	GCC	2	6	1400	1405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978187
22	NC_006462	CGC	2	6	1429	1434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978187
23	NC_006462	CCA	2	6	1484	1489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978187
24	NC_006462	CCT	2	6	1511	1516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978187
25	NC_006462	TCC	2	6	1517	1522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978187
26	NC_006462	CAC	2	6	1617	1622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978187
27	NC_006462	CACCG	2	10	1627	1636	20 %	0 %	20 %	60 %	55978187
28	NC_006462	CAC	2	6	1695	1700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978187
29	NC_006462	C	6	6	1748	1753	0 %	0 %	0 %	100 %	55978187
30	NC_006462	GTAG	2	8	1767	1774	25 %	25 %	50 %	0 %	55978187
31	NC_006462	TCC	2	6	1885	1890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978188
32	NC_006462	CGTC	2	8	1916	1923	0 %	25 %	25 %	50 %	55978188
33	NC_006462	CCA	2	6	1957	1962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978188
34	NC_006462	TCC	2	6	2049	2054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978188
35	NC_006462	GGC	2	6	2060	2065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978188
36	NC_006462	CCCT	2	8	2127	2134	0 %	25 %	0 %	75 %	55978188
37	NC_006462	GGA	2	6	2146	2151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978188
38	NC_006462	GTG	2	6	2163	2168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978188
39	NC_006462	GCC	2	6	2217	2222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978188
40	NC_006462	CAT	2	6	2231	2236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55978188
41	NC_006462	TCT	2	6	2251	2256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978188
42	NC_006462	AGG	2	6	2286	2291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978188
43	NC_006462	TCC	2	6	2298	2303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978188
44	NC_006462	GCC	2	6	2331	2336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978188
45	NC_006462	TCC	2	6	2385	2390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978189
46	NC_006462	GAG	2	6	2420	2425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978189
47	NC_006462	GCCCTT	2	12	2435	2446	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	55978189
48	NC_006462	CCT	2	6	2447	2452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978189
49	NC_006462	GCC	2	6	2467	2472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978189
50	NC_006462	AGG	2	6	2475	2480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978189
51	NC_006462	GGGGC	2	10	2545	2554	0 %	0 %	80 %	20 %	55978189
52	NC_006462	CCT	2	6	2605	2610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978189
53	NC_006462	TCC	2	6	2637	2642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978189
54	NC_006462	TGA	2	6	2728	2733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55978190
55	NC_006462	GCC	2	6	2802	2807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978190
56	NC_006462	CTC	2	6	2813	2818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978190
57	NC_006462	C	6	6	2818	2823	0 %	0 %	0 %	100 %	55978190
58	NC_006462	CCT	2	6	2869	2874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978190
59	NC_006462	CTC	2	6	3382	3387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978191
60	NC_006462	ACCG	2	8	3424	3431	25 %	0 %	25 %	50 %	55978191
61	NC_006462	GCC	2	6	3434	3439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978191
62	NC_006462	GAG	2	6	3466	3471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978191
63	NC_006462	CTC	2	6	3499	3504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978191
64	NC_006462	GGA	2	6	3758	3763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978192
65	NC_006462	TGCGGG	2	12	3769	3780	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	55978192
66	NC_006462	GGT	2	6	3788	3793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978192
67	NC_006462	ACCCGG	2	12	3844	3855	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	55978192
68	NC_006462	GCG	2	6	3923	3928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978192
69	NC_006462	C	6	6	4114	4119	0 %	0 %	0 %	100 %	55978193
70	NC_006462	CAC	2	6	4137	4142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978193
71	NC_006462	CCT	2	6	4145	4150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978193
72	NC_006462	GCC	2	6	4175	4180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978193
73	NC_006462	CGC	2	6	4204	4209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978193
74	NC_006462	TCCCC	2	10	4287	4296	0 %	20 %	0 %	80 %	55978193
75	NC_006462	CA	3	6	4342	4347	50 %	0 %	0 %	50 %	55978194
76	NC_006462	CCA	2	6	4373	4378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978194
77	NC_006462	TCC	2	6	4465	4470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978194
78	NC_006462	GGC	2	6	4476	4481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978194
79	NC_006462	CCCT	2	8	4543	4550	0 %	25 %	0 %	75 %	55978194
80	NC_006462	AAG	2	6	4552	4557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55978194
81	NC_006462	GTG	2	6	4579	4584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978194
82	NC_006462	TGT	2	6	5051	5056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55978195
83	NC_006462	CTC	2	6	5080	5085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978195
84	NC_006462	TGG	2	6	5088	5093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978195
85	NC_006462	GAA	2	6	5142	5147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55978195
86	NC_006462	TTCC	2	8	5151	5158	0 %	50 %	0 %	50 %	55978195
87	NC_006462	GAA	2	6	5205	5210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55978195
88	NC_006462	AGGAG	2	10	5235	5244	40 %	0 %	60 %	0 %	55978195
89	NC_006462	GAG	2	6	5272	5277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978195
90	NC_006462	GAG	2	6	5299	5304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978195
91	NC_006462	AGGA	2	8	5317	5324	50 %	0 %	50 %	0 %	55978195
92	NC_006462	C	6	6	5354	5359	0 %	0 %	0 %	100 %	55978195
93	NC_006462	CTC	2	6	5368	5373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978195
94	NC_006462	CCAGGG	2	12	5499	5510	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55978195
95	NC_006462	TCC	2	6	5513	5518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978195
96	NC_006462	GCG	2	6	5521	5526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978195
97	NC_006462	G	6	6	5627	5632	0 %	0 %	100 %	0 %	55978195
98	NC_006462	GCC	2	6	5637	5642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978195
99	NC_006462	AGT	2	6	5652	5657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55978195
100	NC_006462	AGG	2	6	5675	5680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978195
101	NC_006462	GCC	2	6	5685	5690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978195
102	NC_006462	CGGG	2	8	5774	5781	0 %	0 %	75 %	25 %	55978196
103	NC_006462	GCC	2	6	5803	5808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978196
104	NC_006462	GCG	2	6	5831	5836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978196
105	NC_006462	CTCC	2	8	5862	5869	0 %	25 %	0 %	75 %	55978196
106	NC_006462	TCC	3	9	5872	5880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978196
107	NC_006462	CCG	2	6	5907	5912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978196
108	NC_006462	CCA	2	6	5936	5941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978196
109	NC_006462	GAA	2	6	5978	5983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55978196
110	NC_006462	CGCTC	2	10	6114	6123	0 %	20 %	20 %	60 %	55978197
111	NC_006462	C	6	6	6126	6131	0 %	0 %	0 %	100 %	55978197
112	NC_006462	CGG	2	6	6140	6145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978197
113	NC_006462	CCA	2	6	6193	6198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978197
114	NC_006462	CTC	3	9	6205	6213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978197
115	NC_006462	C	6	6	6275	6280	0 %	0 %	0 %	100 %	55978197
116	NC_006462	TCC	2	6	6293	6298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978197
117	NC_006462	GCCAG	2	10	6324	6333	20 %	0 %	40 %	40 %	55978197
118	NC_006462	TCC	2	6	6335	6340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978197
119	NC_006462	CCA	2	6	6381	6386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978197
120	NC_006462	CCA	2	6	6399	6404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978197
121	NC_006462	ACC	2	6	6434	6439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978197
122	NC_006462	G	6	6	6442	6447	0 %	0 %	100 %	0 %	55978197
123	NC_006462	GGT	2	6	6462	6467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978197
124	NC_006462	CCT	2	6	6537	6542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978197
125	NC_006462	AGG	2	6	6558	6563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978197
126	NC_006462	AGGG	2	8	6566	6573	25 %	0 %	75 %	0 %	55978197
127	NC_006462	CTC	2	6	6625	6630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978197
128	NC_006462	CAC	2	6	6682	6687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978197
129	NC_006462	GGC	2	6	6714	6719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978197
130	NC_006462	GGA	2	6	6804	6809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978197
131	NC_006462	CTC	2	6	6817	6822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978197
132	NC_006462	C	6	6	6857	6862	0 %	0 %	0 %	100 %	55978197
133	NC_006462	CGG	2	6	6866	6871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978197
134	NC_006462	CCT	2	6	6921	6926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978197
135	NC_006462	C	7	7	6933	6939	0 %	0 %	0 %	100 %	55978197
136	NC_006462	CCA	2	6	6957	6962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978197
137	NC_006462	GGC	2	6	6991	6996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978197
138	NC_006462	CTTC	2	8	7005	7012	0 %	50 %	0 %	50 %	55978197
139	NC_006462	AGA	2	6	7109	7114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55978198
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267	NC_006462	ACC	2	6	12010	12015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978204
268	NC_006462	GAT	2	6	12084	12089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55978205
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270	NC_006462	CTC	2	6	12165	12170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978205
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272	NC_006462	C	6	6	12183	12188	0 %	0 %	0 %	100 %	55978205
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399	NC_006462	ACG	2	6	18786	18791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55978212
400	NC_006462	GGA	2	6	18892	18897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978212
401	NC_006462	GCCC	2	8	18931	18938	0 %	0 %	25 %	75 %	55978212
402	NC_006462	GAG	2	6	19034	19039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978212
403	NC_006462	GCG	3	9	19070	19078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978212
404	NC_006462	CACC	2	8	19093	19100	25 %	0 %	0 %	75 %	55978212
405	NC_006462	CCA	2	6	19108	19113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978212
406	NC_006462	C	6	6	19216	19221	0 %	0 %	0 %	100 %	55978212
407	NC_006462	TCC	2	6	19227	19232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978212
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409	NC_006462	C	6	6	19300	19305	0 %	0 %	0 %	100 %	55978212
410	NC_006462	GGA	2	6	19306	19311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978212
411	NC_006462	CGGCT	2	10	19313	19322	0 %	20 %	40 %	40 %	55978212
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430	NC_006462	CCT	2	6	19796	19801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978213
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434	NC_006462	TCC	2	6	19867	19872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978213
435	NC_006462	ACCA	2	8	19902	19909	50 %	0 %	0 %	50 %	55978213
436	NC_006462	GCC	3	9	19959	19967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978213
437	NC_006462	G	6	6	19975	19980	0 %	0 %	100 %	0 %	55978213
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